1、提高消化酶活性、提高饲料吸收利用率、促进鱼虾类生长
    在饲料中添加EM制剂，有益微生物生长良好，经一系列生理生化反应产生生理活性物质，从而促进消化道分解酶活性的提高，促进对饲料的消化吸收，进而促进鱼虾生长。
    2、净化水质，同时兼具独有特色的肥水功能，改善水中生态环境，始终保持水质良性循环
    其含有的多种有益微生物能对症对应各施其责，迅速清除养殖过程中造成的氨氮、硫化氢、亚硝酸盐、甲基硫醇、三甲胺等各种顽固有害物质，保持水质清爽，维持鱼虾健康生长；能使重金属离子、混浊度、ＣＯＤ（化学需氧量）、ＢＯＤ（生化需氧量）等均下降，而ＤＯ（溶解氧）上升，水质得到改善，酸碱度PH值平衡稳定；分解残料及动物粪便，以免沉入塘底产生有害物质，并能活化淤泥和有机物质，转变成藻类和生物可吸收利用的游离状态，达到肥水增产作用。
    3、改善机体微生态系统，提高机体免疫力和抗病力
    黄永春等利用EM作为饲料添加剂饲养建鲤发现：实验组建鲤的红细胞、血红蛋白含量均高于对照组，而耗氧率低于对照组，血液指标明显改善，耗氧率下降，使鱼类具有较高的抗逆性。桂明远等将EM饲料添加剂在鲤爆发性肝炎治疗的效果的初步研究报告表明：生态制剂可以调整肠道内菌群的微生态平衡，刺激鱼类细胞系统（如T细胞系统），从而形成高效价的特异性抗体，增加鱼类免疫力，减少死亡率。
    众所周知，使用化学药品，除会造成病原体产生抗药性和污染水域环境外，还会杀害水中有益微生物，造成微生态失调。因此，郑天凌（1994）指出：对鱼虾疾病用药物防治是暂时性手段，生态防治才是解决问题的关键。